El presente proyecto tiene por objeto propender al desarrollo sostenible de los recursos hídricos de la Cuenca del Río Uruguay, estudiando las condiciones de contaminación y calidad de aguas del propio río y de sus diferentes afluentes, a través de una secuencia progresiva de Etapas de 3 años de duración. El proyecto reconoce dos etapas previas durante las cuales se realizaron estudios básicos sobre la calidad de agua del Río Uruguay evaluando los impactos de las ciudades ribereñas de Concepción del Uruguay, Paysandú, Colón, Concordia y Salto, así como del Río Gualeguaychú en los alrededores de la ciudad homónima.